轉錄活性常染色質與碰壁遏異染色質的染色質傳統分類曾是一個有用的模子,但它應當進行升級,以安適人們日益提升的有關染色質性能域的常識。一項在果蠅中對與蛋白質有關的53種染色質進行的大肆綜合性全基因組解析表示,染色質有五種重要類型;這些可以構成繪出表觀基因組的新框架。
阿姆斯特丹市荷蘭癌癥研討所的Guillaume J Filion和同事從染色質蛋白質組中抉擇了一組廣大的蛋白質,并應用Dam想法在一個胚胎果蠅細胞株中繪制了它們的基因組位置。在這項專業中,每種感嗜好的蛋白質都被融合了DNA腺嘌呤甲基遷移酶Dam,它應用一個甲基腺嘌呤行蹤標誌了蛋白質—DNA的互相作用位點。研討人員隨后應用一種數據驅動的算計分類手段在整個基因組中鑒別出了周期性的、徹底差異的蛋白質組合。基因組區域——長度從1kb變動到100多kb——通過它們的蛋白質信號而分成財神娛樂城ptt了5個清楚的種別,并且研討人員給每一個種別賦予了一個有色彩的名字。
綠色類和藍色類染色質與兩種之前定義的碰壁遏異染色質類型相一致:代表的異財神娛樂城app染色質包含有異染色質蛋白質1HP1、綠染色質和多梳組PcG關聯染色質藍色染色質。應用染色質免疫沉淀反映,Filion等人還發明組蛋白在綠色和藍色區域變更了,這與這些異染色質亞型之前的認知相匹配。
奪目的是,研討人員發明碰壁遏異染色質的最充沛的格式——蓋住了48的基因組并且或許形成大的區域100 kb——是一種新類型被起名為白色。盡管白色染色質域相對基因貧困——它們涵蓋了大于4000個基因,Filion等人發明這些基因沒有或只有極度有限的轉錄活性。插入白色區域的報道轉基因一般都是碰壁遏的,這意味著白色染色質的活性壓制了轉錄。在胚胎細胞的寡言白色區域中的基因在一些其他的結構中也有表白,因此研討人員猜想這種格式的染色質能夠與發育調控有關,至少是部門關連。
Dam數據的分類同時表示,常染色質涵蓋有兩個截然差異的類型。黃色和紅色染色質都含有蛋白質和組蛋白變財神娛樂城體驗金更——這是轉錄活性區域的特色——并產生大批的mRNA,不過紅色染色質攜帶了幾種對于這種染色質而言是獨一無二的調節蛋白質,包含有核小體改建Bra財神娛樂城詐騙hma。同樣,盡管是相似程度的轉錄,組蛋白H3在賴氨酸36上的三甲基化——這之財神娛樂城 老虎機前被繪出為轉錄延長的一種全面的標誌——被高度富集于黃色區域中的基因,但在紅色染色質中卻沒有。有趣的是,活性染色質的這兩種格式可能反應了差異基因類型的徹底差異的調控機制:黃色染色質中的基因具有占優的廣泛表白,并具有根本的細胞性能,然而紅色染色質區域中的基因則加倍不同凡響。研討人員在近期出書的《細胞》雜志上匯報了這一研討成績。
研討人員指出,與染色質有關的蛋白質被廣泛保留于物種中,因此很可能這種分類將廣泛實用。新區域類型的更多研討將為染色質如何協助管理基因表白提供一個更奧妙的意見。