假如你走進任何一家醫療機構，向任何一個身穿白大褂的大夫訊問有關微生物的事，他們只知道把血液樣本送到培育室，然后分解它們。賓夕法尼亞匹茲堡大學新生兒外科大夫邁克爾·莫羅維茨說。
然而人體中微生物細菌變動多端、敏捷多樣，差異的菌種隨時能跟其他菌群結成差異的聯合，人體細胞和它們的微生物住民之間也存在著不停地互相聯系，更提升了額外的復雜性。面臨巨大的微生物大水，研討人體微生物的科學家需求變更思路。
奇異三人組
加利福尼亞大學伯克利分校的微生物學家吉莉安·班菲爾德一直在研討偏激環境中的細菌。本年9月，她在加利福尼亞鐵山布滿硫磺的理查曼德礦帶，蒐集藍色鐘乳石里滲出的酸性很強的水；而一年前，她在科羅拉多來福爾地域一個廢棄核處置站，抽取含有鈾、砷、鉬及其他地下金屬元素的有毒融合湯。她從這兩個站點采回樣本，解析此中涵蓋的DNA，研討能在那種地獄般環境存活下來的細菌、古生菌、病毒及真菌究竟有哪些。
邁克爾·莫羅維茨，其時是芝加哥大學的新生兒外科大夫，目前在賓夕法尼亞匹茲堡大學進行壞死性小腸結腸炎NEC關連研討，約7的早產嬰兒沾染了壞死性小腸結腸炎，但臨床上常常無法及時診斷出來而拖延了調治。嚴重的場合，大夫必要清理一部門或所有腸子，很多嬰兒城市死掉。幾十年來，醫學界一直在尋找病原菌而沒能勝利。2009年1月，莫羅維茨開端研討NEC。我懷疑不能能找到這種病原菌，所以我抉擇了差異的想法來研討這個疑問，把人作為一個整體的有機物群落。
另一位配合者是戴維·瑞爾曼，在加利福尼亞斯坦福大學研討人體微生物群落。 班菲爾德和研討小組開闢了一種專業，能從大批微生物DNA序列零碎辨別出它們的屬系和品種，用軟件來解析各菌種的地位特征、新陳代謝及性能，以揭示菌群的生化過程。對比之下，當前通行的16S核糖體RNA基因測序和一些主動化生物信息解析難于顯示相近微生物屬種間的差異，很難揭示一些渺小的基因重排。
但這種想法只能用來解析簡樸的群落，例如理查曼德礦帶，其最大數目的菌種占了整個群體的40。而成人腸道含有數百種微生物，數目最大的菌種只占4。但我們的研討并非不能進行。瑞爾曼說，他想同樣細致地解析人體微生物，早產嬰兒是試驗班菲爾德專業的最佳對象。每個早產新生兒體內菌種只有12種擺佈，與酸礦廢水相當，增強保養病房制造了一個無菌的、高度管理的環境來研討它們。
3人在一年前開端了配合，把班菲爾德的專業用在了早產新生兒身上，財神娛樂城下載他們會合于康健嬰兒。莫羅維茨每日采集新生兒糞便樣本，分解DNA送到高通量測序中央，將數據發給班菲爾德和瑞爾曼；瑞爾曼用16S測序做菌種和數目普查；班菲爾德抉擇一些節點作更詳細測序，解析種類和基因場合。
他們研討了孕28周早產嬰兒在前三周里的性命場合，追蹤了微生物群在種類數目上詳細快速的變動，以查找是否存在某種不同凡響的細菌或菌群與NEC有關，并幫助預計哪種嬰兒輕易染病，進而找出預防設法。進一步，他們但願繪制出新生兒腸道菌群的簡化模子，將這些生態原理開拓利用到人類的微生物體制中。
生態微生物學與人體微生物學交叉
瑞爾曼和其他研討人員在已往5年里創設了人類微生物群落的遺傳目次：哪種微生物生涯在哪兒。數百種相互作用、相互增進的物種，生涯在每自己的體表和體內，每自己的微生物群落之間還有重疊。
研討人員想知道在人體環境中，微生物在免疫性能、養分、藥物代謝方面，以及糖尿病、癌癥、高傲癥和多倍體硬化癥等疾病中的作用。為了進行這些研討，他們必要進行大批的基因測序，解析群落里有哪些微生物，在一天之中它們如何變動，終生或飲食變動之后如何變動，某種微生物、微生物聯盟以及微生物代謝物都有哪些性能等。
生態微生物學家給人類微生物界帶來了生態原理：殖民、接管、回彈、兩個群體間的競爭與配合等。科學疑問的確存在交叉。班菲爾德說：例如殖民是指細菌初次達到棲身地開端群體進化，這是一種生態上的持續性。當你看到一個酸礦廢水池塘的外表，想像一下起初的有機物種奈何達到那里，同樣可以想像新生嬰兒，起初如何被細菌入侵的。
生態微生物學家開端研討人類腸道、皮膚、口腔及其他微生物群落，他們已經走出了土壤、海洋、有毒廢場等環境微生物領域財神娛樂。
生態微生物原理離臨床利用尚有間隔
嬰兒一誕生，初次曝光在微生物中之后，性命就開端受到無停止的圍攻。不同種類細菌、病毒和真菌將它們的殖民地擴展進人類的皮膚、眼睛、肺、胃腸道等每一處曝光的器官。瑞爾曼說：在面臨病原體時，我們必要戰勝‘一種細菌一種病’的整體一維視角，菌群才是研討單元。
人類細胞和他們的微生物搭檔作為一種相互增進的財神娛樂城技巧教學超等有機體，各別都為對方提供了辦事。美國國家衛生研討院2007年終開端了一項為期5年的人類微生物組方案HMP，致力于給人類巨大的微生物組測序。項目主管麗塔·普羅科特說：要真正懂得我們作為一個有機體的性能，需求包含有人體的整個微生物群落，它們與我們的康健和性命息息關連，任務量比人類基因組還要大100倍。本年研討人員辦妥了取自人體差異部位的178種微生物基因組的測序和解析，發明其基因編碼含有過份3萬種蛋白質。
盡管生態微生物學提供財神娛樂下載了一個框架來懂得人類微生物群落，但它的所有想法和原理，離臨床利用都還有一定間隔。縱然研討人員找到了某種細菌和某種疾病之間確實切聯系，也沒設法通過清理一種細菌或引入另一種細菌的想法來贏 財神 娛樂 城管理細菌群落。抗生素偏向于殺害關連的細菌，而不可殺害一個菌群，更無法產生菌群或移植它們。
珍妮特·簡森是加利福尼亞大學伯克利分校的一位土壤微生物學家，正在研討造成克羅恩氏病腸道紊亂的關連細菌。研討小組的克萊爾·弗萊瑟-利格特說，這些菌群有很強的安適性，能從頭占領被抗生素搗亂的環境嗎？我們如何檢測才幹答覆這個疑問？在它們的回復期間發作了什麼？所有這些疑問可能需求生態微生物學家們花數十年研討時間來尋找答案。
